核仁是真核細(xì)胞間期核中最明顯的結(jié)構(gòu)。它位于細(xì)胞核中。為生殖做出了貢獻(xiàn),并聚集著核糖體。曾經(jīng)集合的核糖體從細(xì)胞核中出來,進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。對(duì)核仁結(jié)構(gòu)、動(dòng)態(tài)和功能的研究,不僅為早期細(xì)胞學(xué)家所密切注意,而且在20世紀(jì)60年代發(fā)現(xiàn)核仁的重要功能以后,也一直受到各相關(guān)領(lǐng)域研究者的高度重視。
2021年7月30日,中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)陳玲玲研究組和劉珈泉研究組在《Science》發(fā)表了合作研究成果“l(fā)ncRNA SLERT controls phase separation of FC/DFCs to facilitate Pol I transcription”,并獲同期Perspectives專評(píng)。該研究首次揭示了長非編碼RNA SLERT以RNA分子伴侶機(jī)制改變互作核仁蛋白DDX21構(gòu)象進(jìn)而影響FC/DFC區(qū)域的大小和流動(dòng)性,維持RNA聚合酶I高效轉(zhuǎn)錄生成核糖體RNA。
(A)左上:體外相分離實(shí)驗(yàn)中,纖維狀DDX21的形成隨蛋白濃度降低而減弱;左下:在不同的實(shí)驗(yàn)體系中,不同濃度的DDX21蛋白呈現(xiàn)不同的分子狀態(tài),SLERT可以增加DDX21蛋白的流動(dòng)性;右:體內(nèi)實(shí)驗(yàn)和體外重構(gòu)實(shí)驗(yàn)中,SLERT通過結(jié)合DDX21增加FC/DFC轉(zhuǎn)錄單元的大小和流動(dòng)性。
(B)DDX21分子抱團(tuán)聚集在核仁DFC區(qū)域的外側(cè),并且限制FC/DFC區(qū)域的大小和流動(dòng)性。SLERT調(diào)控DDX21的構(gòu)象由開放轉(zhuǎn)為閉合,DDX21分子呈現(xiàn)低聚的疏松狀態(tài),為Pol I的高效轉(zhuǎn)錄提供合適的空間環(huán)境。Pol I轉(zhuǎn)錄發(fā)生在FC和DFC的交界處,DDX21卷曲纏繞rDNA阻止Pol I轉(zhuǎn)錄復(fù)合物在rDNA的占位。SLERT調(diào)控DDX21的構(gòu)象和流動(dòng)性抑制DDX21對(duì)rDNA的纏繞從而促進(jìn)Pol I轉(zhuǎn)錄。
該工作首次發(fā)現(xiàn)SLERT以RNA分子伴侶機(jī)制調(diào)控蛋白質(zhì)的構(gòu)象和多聚狀態(tài)并且觀察到單分子水平下蛋白質(zhì)微觀相分離的功能特征和調(diào)控機(jī)制。蛋白質(zhì)的多聚狀態(tài)與其流動(dòng)性,分子間相互作用以及功能發(fā)揮直接相關(guān),RNA分子伴侶通過跨越數(shù)量級(jí)調(diào)控核仁蛋白質(zhì)相分離特性維持細(xì)胞核仁正常的形態(tài)功能,對(duì)lncRNA領(lǐng)域和相分離領(lǐng)域的深入研究具有重大意義。
全式金無縫拼接系列產(chǎn)品pEASY?-Basic Seamless Cloning and Assembly Kit(CU201)與感受態(tài)細(xì)胞產(chǎn)品Transetta(DE3) Chemically Competent Cell(CD801)攜手助力該項(xiàng)研究。
產(chǎn)品優(yōu)勢:
1、pEASY?-Basic Seamless Cloning and Assembly Kit(CU201)
利用特殊的重組酶和同源重組的原理,可以將任意方法線性化后的載體和與其兩端具有15-25 bp 重疊區(qū)域的PCR 片段定向重組,可實(shí)現(xiàn)1-5 個(gè)片段的高效無縫拼接。
- 快速:僅需要15分鐘反應(yīng)時(shí)間。
- 簡單:不受片段酶切位點(diǎn)的影響,無需對(duì)片段酶切。
- 高效:陽性率達(dá)95%以上。
- 無縫:不引入額外的序列。
單片段高效連接實(shí)驗(yàn)
1 kb PCR 片段插入pUC19 載體后,PCR 鑒定插入效果。結(jié)果顯示,插入片段的陽性率達(dá)100%。
單片段插入后,挑取60 個(gè)單克隆菌落進(jìn)行PCR 鑒定
M: Trans2K? Plus II DNA Marker
不同長度單片段連接實(shí)驗(yàn)
不同長度PCR片段(50 bp、2 kb、5 kb、8 kb)分別插入PG載體后,分別用內(nèi)切酶酶切鑒定插入效果。結(jié)果顯示,不同長度的PCR片段均正確插入PG載體。
單片段插入后酶切
不同長度多片段連接實(shí)驗(yàn)
不同長度PCR片段(600 bp,900 bp,1200 bp,1500 bp,1800 bp,片段兩端設(shè)計(jì)Nde I酶切位點(diǎn)),混合后插入pUC19載體后,Nde I酶切鑒定插入效果。結(jié)果顯示,不同長度的PCR片段均正確插入pUC19載體。
多片段插入后酶切
2、Transetta(DE3) Chemically Competent Cell(CD801)
Transetta(DE3)是采用進(jìn)口菌株,特殊工藝制作,可用于DNA的化學(xué)轉(zhuǎn)化。細(xì)胞具有氯霉素(Camr)抗性。使用pUC19質(zhì)粒DNA檢測,轉(zhuǎn)化效率可達(dá)107 cfu/μg DNA。使用Control Plasmid I (Amp+)用于檢測細(xì)胞是否具有表達(dá)功能,表達(dá)蛋白大小為25 kDa。
特點(diǎn)
該菌株是攜帶氯霉素抗性質(zhì)粒BL21的衍生菌,補(bǔ)充大腸桿菌缺乏的6種稀有密碼子(AUA, AGG, AGA,CUA, CCC, GGA)對(duì)應(yīng)的tRNA,提高外源基因,尤其是真核基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)水平。
相關(guān)產(chǎn)品推薦:
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