線粒體是細(xì)胞的“能量工廠”，在能量穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮重要的作用。線粒體DNA單堿基突變就可導(dǎo)致發(fā)育障礙、神經(jīng)肌肉疾病等多種疾病。開發(fā)針對(duì)線粒體DNA的基因編輯工具一直是線粒體遺傳學(xué)領(lǐng)域的長(zhǎng)期目標(biāo)。DdCBE線粒體堿基編輯器可針對(duì)雙鏈線粒體DNA，將C·G堿基對(duì)編輯為T·A堿基對(duì)，實(shí)現(xiàn)對(duì)線粒體的精準(zhǔn)定向編輯。而，一個(gè)的潛在安全隱患是線粒體靶向信號(hào)的介導(dǎo)能否保證全部 DdCBE 定位在線粒體中，而不是部分泄露到細(xì)胞核，從而造成潛在的脫靶編輯。因此對(duì)核基因組脫靶效應(yīng)及工具本身的安全性評(píng)估是極為必要的。
2022年5月12日，北京大學(xué)伊成器團(tuán)隊(duì)在Nature雜志發(fā)表了題為“Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations”的研究論文。該研究應(yīng)用了該團(tuán)隊(duì)之前發(fā)表的Detect-seq技術(shù)，對(duì)DdCBE堿基編輯工具在人類細(xì)胞中核基因組脫靶編輯進(jìn)行了無(wú)偏向性地評(píng)估，并探索了相關(guān)機(jī)制，發(fā)現(xiàn)了TAS依賴型和TAS非依賴型的脫靶；并意外發(fā)現(xiàn)由細(xì)菌毒素 DddA 構(gòu)成的 DdCBE 堿基編輯工具與維持細(xì)胞三維結(jié)構(gòu)的重要蛋白 CTCF有相互作用。本研究對(duì)DdCBE堿基編輯工具在基礎(chǔ)研究和疾病治療中的應(yīng)用具有重要的意義。
優(yōu)質(zhì)的試劑是科學(xué)研究的利器。該團(tuán)隊(duì)在細(xì)胞培養(yǎng)的過程中，使用全式金TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit對(duì)支原體檢測(cè)，確保細(xì)胞無(wú)支原體污染；在基因克隆實(shí)驗(yàn)中使用TransStart? FastPfu DNA Polymerase進(jìn)行PCR 片段擴(kuò)增，并將成功構(gòu)建的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入Trans1-T1 Phage Resistant化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞。
TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit（FM311）
一款高效的PCR法支原體檢測(cè)試劑盒，特異性擴(kuò)增支原體DNA。因操作簡(jiǎn)便、快速（2小時(shí)內(nèi)即可出結(jié)果）、特異性強(qiáng)、靈敏度高的特點(diǎn)備受客戶喜愛，多次榮登Nature期刊。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
· 靈敏度高，可檢測(cè)低至20個(gè)拷貝的支原體。
· 特異性強(qiáng)，只擴(kuò)增支原體DNA，真核細(xì)胞和細(xì)菌DNA不被擴(kuò)增。
· 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需提取基因組DNA，適合大量細(xì)胞樣品的檢測(cè)。
· 配有陽(yáng)性對(duì)照與陰性對(duì)照，保證PCR檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
TransStart? FastPfu DNA Polymerase（AP221）
一款快速PCR的熱啟動(dòng)高保真DNA聚合酶，克服了普通Pfu酶擴(kuò)增效率低、產(chǎn)量低和擴(kuò)增速度慢的缺陷。該產(chǎn)品自上市以來(lái)備受客戶喜愛，多次榮登Nature、Nature biotechnology、Molecular cell等知名期。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
· 保真性是EasyTaq? DNA Polymerase的54倍。
· 擴(kuò)增產(chǎn)物為平端，可直接克隆于pEASY?-Blunt系列載體中。
· 基因組DNA片段的擴(kuò)增 (≤ 15 kb)。
· Plasmid DNA片段的擴(kuò)增 (≤ 20 kb)。
Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell（CD501）
一款經(jīng)特殊工藝制作的化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞，轉(zhuǎn)化效率高達(dá)109cfu/ug DNA以上。自上市以來(lái)備受客戶喜愛，轉(zhuǎn)化效率高、產(chǎn)品性能穩(wěn)定，多次榮登Nature、Cell等知名期刊。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
· 生長(zhǎng)速度快，在氨芐青霉素平板上，8-9小時(shí)可見克隆。
· 用于藍(lán)、白斑篩選，12小時(shí)可見藍(lán)斑。
· 將過夜培養(yǎng)的單克隆在2 ml的LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)4-5小時(shí)即可進(jìn)行小量質(zhì)粒提取。
· 適用于高效的DNA克隆和質(zhì)粒擴(kuò)增，減少克隆DNA同源重組的發(fā)生，提高質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量。
· 具有T1, T5噬菌體抗性。
全式金產(chǎn)品再次登上Nature期刊，證明了大家對(duì)全式金產(chǎn)品品質(zhì)和服務(wù)的認(rèn)可，也完美的詮釋了全式金“品質(zhì)高于一切，精品服務(wù)客戶”的理念。未來(lái)，全式金將繼續(xù)秉持“匠心”與“創(chuàng)新”，打造更多精品，助力科學(xué)研究。
使用TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit（FM311）產(chǎn)品發(fā)表的部分文章：
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Modulating TRADD to restore cellular homeostasis and inhibit apoptosis[J]. Nature, 2020.
· Rapamycin pretreatment rescues the bone marrow AML cell elimination capacity of CAR-T cells[J]. Clinical Cancer Research, 2021.
使用TransStart? FastPfu DNA Polymeras（AP221）產(chǎn)品發(fā)表的部分文章：
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· An engineered prime editor with enhanced editing efficiency in plants[J]. Nature Biotechnology, 2022.
· Genome-wide specificity of prime editors in plants[J]. Nature Biotechnology, 2021.
· Precise, predictable multi-nucleotide deletions in rice and wheat using APOBEC–Cas9[J]. Nature Biotechnology, 2020.
· Targeted, random mutagenesis of plant genes with dual cytosine and adenine base editors[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Prime genome editing in rice and wheat[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Rationally designed APOBEC3B cytosine base editors with improved specificity[J]. Molecular cell, 2020.
· The raphe dopamine system controls the expression of incentive memory[J]. Neuron, 2020.
· Taf14 recognizes a common motif in transcriptional machineries and facilitates their clustering by phase separation[J]. Nature communications, 2020.
使用Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell（CD501）產(chǎn)品發(fā)表的部分文章：
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Whitefly hijacks a plant detoxification gene that neutralizes plant toxins[J]. Cell, 2021.
· Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells[J]. Cell, 2020.
· A defense pathway linking plasma membrane and chloroplasts and co-opted by pathogens[J]. Cell, 2020.
· LDPE microplastics affect soil microbial communities and nitrogen cycling[J]. Science of The Total Environment, 2021.
· Consumption of miRNA-Mediated Insect-Resistant Transgenic Rice Pollen Does Not Harm Apis mellifera Adults[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021.
· Integrative Proteomic and Phosphoproteomic Analyses of Granulosa Cells During Follicular Atresia in Porcine[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2020.
· Dynamics and Regulations of BimEL Ser65 and Thr112 Phosphorylation in Porcine Granulosa Cells during Follicular Atresia[J]. Cells, 2020.
